น้ำขึ้น-น้ำลง เป็นปัจจัยสิ่งแวดล้อมอย่างหนึ่งที่สำคัญต่อระบบนิเวศป่าชายเลน โดยการขึ้นและลงของน้ำทะเลฝั่งอ่าวไทยจะขึ้นลงวันละ 1 ครั้ง แต่ฝั่งอันดามันจะขึ้นลงวันละ 2 ครั้ง

..พื้นที่ป่าชายเลนบริเวณสวนพฤกษ์ฯนี้ อาจจะบอกได้ว่า..ในช่วงเดือนกันยายน-ตุลาคม น้ำขึ้นสูงช่วงบ่ายถึงเย็น ..เดือนพฤศจิกายน-กุมภาพันธ์ น้ำขึ้นเต็มตลอดทั้งวัน ..เดือนมีนาคม-เมษายน น้ำขึ้นเต็มช่วงเช้าและลงตอนบ่าย ..ช่วงเดือนพฤษภาคม-สิงหาคม น้ำลงกลางวัน ขึ้นกลางคืน